refactor(core,server): 统一模块职责并消除类型重复

- 统一 ToolStatus 类型（Core 导出，Server 引用）
- 重命名 Server SessionManager 为 SessionMetadataManager
- 扩展 Core PermissionContext 添加结构化字段
- 统一 Part 类型导出（Core 定义存储格式，Server 定义展示格式）
- 简化 Message 格式（移除 MergedMessage，统一使用 Message）
- 添加向后兼容的类型别名和 @deprecated 注释

packages/ui/src/components/ChatMessage.tsx

@@ -22,7 +22,7 @@ import { fadeInUp, smoothTransition } from '../utils/animations';
 import { getAgentDisplayName } from '../utils/agent';
 import { Markdown } from './Markdown';
 import { FileMentionText } from './FileMentionTag';
-import type { Message, ToolCallInfo, ToolCallStatus, ToolMessagePart } from '../api/types.js';
+import type { Message, ToolCallInfo, ToolStatus, ToolMessagePart } from '../api/types.js';
 
 interface ChatMessageProps {
   message: Message;
@@ -319,7 +319,7 @@ function ToolPartItem({ part }: ToolPartItemProps) {
 /**
  * 获取工具状态图标
  */
-function getStatusIcon(status: ToolCallStatus) {
+function getStatusIcon(status: ToolStatus) {
   switch (status) {
     case 'pending':
       return <Clock size={14} className="text-yellow-500" />;