feat: 添加会话持久化和 Todo 工具

会话持久化：
- 新增 SessionManager 和 SessionStorage，支持会话自动保存和恢复
- 会话数据存储在 ~/.local/share/ai-assist/，遵循 XDG 规范
- 支持对话历史、已发现工具、待办事项的持久化
- 启动时自动恢复同一工作目录的上次会话
- 支持会话归档和历史会话管理

Todo 工具：
- 新增 todoread 工具：读取当前会话的待办事项列表
- 新增 todowrite 工具：创建和更新待办事项
- 支持 pending/in_progress/completed 三种状态
- 待办事项随会话自动持久化

其他改进：
- ToolResult 类型新增可选的 metadata 字段
- Agent 支持会话管理器集成
- clearHistory 改为异步方法

src/tools/index.ts

@@ -6,6 +6,7 @@ import { bashTool } from './shell/index.js';
 
 // 核心工具
 import { toolSearchTool } from './tool-search.js';
+import { todoReadTool, todoWriteTool } from './todo/index.js';
 
 // 文件系统工具
 import {
@@ -27,6 +28,8 @@ const allToolsWithMetadata: ToolWithMetadata[] = [
   // 核心工具 (deferLoading: false)
   toolSearchTool,
   bashTool,
+  todoReadTool,
+  todoWriteTool,
 
   // 文件系统工具 (deferLoading: true)
   readFileTool,
@@ -48,6 +51,7 @@ toolRegistry.registerAll(allToolsWithMetadata);
 // 导出
 export { toolRegistry } from './registry.js';
 export { toolSearchTool } from './tool-search.js';
+export { todoManager } from './todo/index.js';
 export type { ToolWithMetadata, ToolMetadata, ToolCategory, ToolSearchResult } from './types.js';
 
 // 兼容旧代码：导出所有工具数组（基础 Tool 类型）