refactor(core): 移除不再需要的文件系统工具

删除以下工具及相关文件：
- copy_file: 复制文件
- create_directory: 创建目录
- delete_file: 删除文件
- move_file: 移动文件
- search_files: 搜索文件

清理范围：
- 工具实现文件 (5个)
- 工具描述文件 (5个)
- 单元测试文件 (6个)
- Agent presets 中的引用
- Checkpoint 系统中的触发类型
- Hook 系统中的相关处理

packages/core/src/tools/filesystem/index.ts

@@ -6,17 +6,10 @@ export { multiEditTool } from './multi_edit.js';
 
 // 目录操作
 export { listDirTool } from './list_directory.js';
-export { createDirectoryTool } from './create_directory.js';
 
 // 搜索
-export { searchFilesTool } from './search_files.js';
 export { globTool } from './glob.js';
 export { grepTool } from './grep.js';
 
 // 文件信息
 export { getFileInfoTool } from './get_file_info.js';
-
-// 文件管理
-export { moveFileTool } from './move_file.js';
-export { copyFileTool } from './copy_file.js';
-export { deleteFileTool } from './delete_file.js';