refactor(storage): 采用 OpenCode 风格三层存储结构

重构消息存储系统，从"每条消息一个文件"改为分层存储：
- Session → Message → Parts 三层结构
- 12 种 Part 类型（TextPart, ToolPart, ReasoningPart 等）
- ToolPart 状态机（pending → running → completed/error）
- 通用 Storage API（read/write/list/remove）

新增文件:
- parts.ts: Part 类型定义（Zod schema）
- message.ts: MessageInfo 类型定义
- id.ts: ID 生成器
- storage/: 分层存储实现

删除旧文件:
- storage.ts, types.ts, migration.ts

存储路径:
~/.local/share/ai-assist/
├── session/{projectId}/{sessionId}.json
├── message/{sessionId}/{messageId}.json
├── part/{messageId}/{partId}.json
└── todo/{sessionId}.json

packages/core/src/tools/todo/todo-manager.ts

@@ -1,6 +1,28 @@
-import type { Todo, TodoStatus } from '../../session/types.js';
+import type { TodoItem } from '../../session/storage/todo.js';
 import type { SessionManager } from '../../session/index.js';
 
+// 兼容旧接口的 Todo 类型
+export type Todo = {
+  id: string;
+  content: string;
+  status: 'pending' | 'in_progress' | 'completed';
+  createdAt: string;
+  updatedAt: string;
+};
+
+export type TodoStatus = 'pending' | 'in_progress' | 'completed';
+
+// 将 TodoItem 转换为 Todo
+function toTodo(item: TodoItem): Todo {
+  return {
+    id: item.id,
+    content: item.content,
+    status: item.status,
+    createdAt: new Date(item.createdAt).toISOString(),
+    updatedAt: new Date(item.updatedAt).toISOString(),
+  };
+}
+
 /**
  * Todo 管理器
  * 提供对当前会话 todo 列表的操作接口
@@ -22,7 +44,7 @@ class TodoManager {
     if (!this.sessionManager) {
       return [];
     }
-    return this.sessionManager.getTodos();
+    return this.sessionManager.getTodos().map(toTodo);
   }
 
   /**

packages/core/src/tools/todo/todowrite.ts

@@ -1,6 +1,6 @@
 import type { ToolResult } from '../../types/index.js';
 import type { ToolWithMetadata } from '../types.js';
-import type { Todo, TodoStatus } from '../../session/types.js';
+import type { Todo, TodoStatus } from './todo-manager.js';
 import { todoManager } from './todo-manager.js';
 
 /**